HOOMD-blue es un paquete de dinámica molecular de uso general diseñado desde el principio para aprovechar la revolucionaria arquitectura CUDA en las GPU NVIDIA. Contiene varios campos de fuerza e integradores diferentes y su diseño orientado a objetos permite agregar algunos de ellos fácilmente.
Descarga e instalación
- Binaries for HOOMD-blue
- Documentation (installation guide, quick start tutorials)
Datos del análisis comparativo
Los análisis comparativos detallados están disponibles en la página de HOOMD-blue. Una GPU Tesla que ejecuta HOOMD-blue puede superar el rendimiento de 32 núcleos de la CPU.
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| Datos cortesía de la Universidad de Michigan |
Presentaciones
- Papers describing HOOMD-Blue
- More publications on accelerating molecular dynamics applications using GPUs
- More publications on accelerating quantum chemistry applications using GPUs
Case Studies
- NCSA, November 2009: The GPUs in NCSA's Lincoln cluster speed molecular dynamics simulations that drive the development of detergents and drug-delivery systems
Discussion Forums
Soluciones de GPU
Se encuentra disponible como una solución de supercomputadora personal de escritorio que puede superar el rendimiento de un clúster de CPU de 32 nodos, o una solución de clúster que ofrece el rendimiento de una supercomputadora de gran escala convencional a un décimo del costo y un vigésimo del consumo de energía. Estas soluciones, incorporadas en la revolucionaria arquitectura CUDA, están diseñadas para acelerar el ritmo de la ciencia computacional.
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| Desktop Workstation Configuration | Data Center Configuration |
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